Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB1P82279 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB1P82279 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRB1P82279 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB1P82279 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms