Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVFC1P60507 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms