Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA9P57773 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA9P57773 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms