Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF3P57682 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF3P57682 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms