Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH15P55291 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH15P55291 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDH15P55291 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms