Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP6P55212 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms