Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA3P52797 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms