Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SMARCA2P51531 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms