Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRE11P49959 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms