Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPFP49454 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPFP49454 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPFP49454 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPFP49454 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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CENPFP49454 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPFP49454 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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