Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms