Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRIP1P48552 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP1P48552 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms