Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms