Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTRNP46939 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTRNP46939 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms