Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRXP46100 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRXP46100 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms