Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms