Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBX2P40425 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBX2P40425 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBX2P40425 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms