Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms