Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RORAP35398 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RORAP35398 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RORAP35398 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RORAP35398 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RORAP35398 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms