Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF2P35227 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms