Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP1P29466 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP1P29466 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms