Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFKBIAP25963 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms