Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO1P25800 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms