Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMO2P25791 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMO2P25791 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMO2P25791 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms