Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms