Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPREP23469 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPREP23469 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPREP23469 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms