Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PTPRDP23468 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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