Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
ERBB3P21860 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERBB3P21860 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms