Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XBP1P17861 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XBP1P17861 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms