Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXB1P14653 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms