Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IFITM1P13164 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms