Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGAMP11215 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGAMP11215 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms