Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2BP0DI82 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms