Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PKHD1P08F94 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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