Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBA3O96018 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APBA3O96018 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APBA3O96018 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms