Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NPHP4O75161 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPHP4O75161 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms