Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNSO60931 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNSO60931 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNSO60931 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms