Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms