Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHX16O60231 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX16O60231 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX16O60231 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX16O60231 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX16O60231 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHX16O60231 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms