Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms