Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SYNJ1O43426 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ1O43426 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms