Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRTM2O43300 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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