Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAA1O43292 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms