Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms