Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBTB39O15060 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBTB39O15060 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBTB39O15060 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBTB39O15060 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms