Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASKO14936 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASKO14936 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASKO14936 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASKO14936 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms