Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms