Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms