Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00587B1AMM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00587B1AMM8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00587B1AMM8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms