Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF839A8K0R7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF839A8K0R7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms